中科院海洋所破譯首個深海甲殼動物基因組
【環球網科技綜合報道】6月24日ri消xiao息xi,記ji者zhe從cong中zhong科ke院yuan官guan網wang了le解jie到dao,近jin日ri,中zhong國guo科ke學xue院yuan海hai洋yang研yan究jiu所suo研yan究jiu員yuan李li富fu花hua課ke題ti組zu和he研yan究jiu員yuan李li新xin正zheng課ke題ti組zu合he作zuo破po譯yi了le國guo際ji上shang首shou個ge深shen海hai甲jia殼ke動dong物wu——深海水虱(Bathynomus jamesi)的基因組,並揭示了深海水虱體型巨大化和深海寡營養環境適應的獨特分子遺傳機製。
據ju悉xi,該gai研yan究jiu是shi繼ji深shen海hai軟ruan體ti動dong物wu和he深shen海hai管guan蟲chong等deng深shen海hai物wu種zhong之zhi後hou,首shou次ci報bao導dao深shen海hai甲jia殼ke動dong物wu基ji因yin組zu,為wei揭jie示shi甲jia殼ke動dong物wu獨du特te的de深shen海hai環huan境jing適shi應ying性xing進jin化hua和he遺yi傳chuan機ji製zhi提ti供gong了le重zhong要yao分fen子zi證zheng據ju。相xiang關guan研yan究jiu成cheng果guo以yi“Genome of a giant isopod, Bathynomus jamesi, provides insights into body size evolution and adaptation to deep-sea environment”為題,發表在《BMC Biology》上。
等足類是甲殼動物中少有的既包含水生、半(ban)陸(lu)生(sheng)和(he)完(wan)全(quan)陸(lu)生(sheng)物(wu)種(zhong),包(bao)含(han)深(shen)海(hai)和(he)淺(qian)海(hai)物(wu)種(zhong)的(de)類(lei)群(qun)。不(bu)同(tong)生(sheng)態(tai)位(wei)的(de)類(lei)群(qun)在(zai)體(ti)型(xing)上(shang)存(cun)在(zai)巨(ju)大(da)差(cha)異(yi),其(qi)中(zhong),深(shen)海(hai)等(deng)足(zu)類(lei)呈(cheng)現(xian)出(chu)體(ti)型(xing)巨(ju)大(da)化(hua)現(xian)象(xiang)。理(li)論(lun)上(shang)講(jiang),深(shen)海(hai)環(huan)境(jing)極(ji)其(qi)惡(e)劣(lie),其(qi)寡(gua)營(ying)養(yang)環(huan)境(jing)不(bu)利(li)於(yu)巨(ju)型(xing)生(sheng)物(wu)的(de)生(sheng)存(cun),因(yin)巨(ju)型(xing)生(sheng)物(wu)需(xu)要(yao)更(geng)多(duo)的(de)絕(jue)對(dui)能(neng)量(liang)。深(shen)海(hai)水(shui)虱(shi)是(shi)深(shen)海(hai)巨(ju)型(xing)等(deng)足(zu)類(lei)的(de)代(dai)表(biao)性(xing)物(wu)種(zhong),因(yin)保(bao)持(chi)世(shi)界(jie)上(shang)最(zui)長(chang)的(de)絕(jue)食(shi)時(shi)間(jian)記(ji)錄(lu)(5年以上)而廣受關注。深海水虱基因組的破譯為揭示巨型甲殼動物適應深海寡營養環境的獨特分子機製提供了重要基礎。
研究人員完成了深海水虱基因組的測序和組裝,構建了高質量的基因組圖譜,其基因組組裝大小達5.89 Gb,是目前已測序甲殼動物中基因組最大的物種。研究發現其基因組中轉座元件的含量高達84%,是shi引yin起qi基ji因yin組zu擴kuo張zhang的de重zhong要yao原yuan因yin。通tong過guo比bi較jiao基ji因yin組zu學xue分fen析xi,研yan究jiu人ren員yuan發fa現xian深shen海hai水shui虱shi基ji因yin組zu內nei多duo條tiao生sheng長chang相xiang關guan信xin號hao通tong路lu上shang的de基ji因yin發fa生sheng了le顯xian著zhu擴kuo張zhang,包bao括kuo兩liang條tiao激ji素su信xin號hao通tong路lu(thyroid and insulin hormone signaling),mTOR信號通路和Hippo 信號通路,說明深海水虱體型巨大化的形成可能與其強化的生長相關信號通路密切相關。
據了解,深海水虱擁有一個被填滿食物的巨大的胃,占身體體積的2/3,還具有發達的用於存儲有機物質的組織——脂(zhi)質(zhi)體(ti)。為(wei)了(le)解(jie)析(xi)深(shen)海(hai)水(shui)虱(shi)營(ying)養(yang)高(gao)效(xiao)利(li)用(yong)機(ji)製(zhi),研(yan)究(jiu)人(ren)員(yuan)對(dui)深(shen)海(hai)水(shui)虱(shi)不(bu)同(tong)組(zu)織(zhi)進(jin)行(xing)了(le)轉(zhuan)錄(lu)組(zu)測(ce)序(xu)和(he)分(fen)析(xi),發(fa)現(xian)大(da)量(liang)糖(tang)代(dai)謝(xie)和(he)膜(mo)泡(pao)運(yun)輸(shu)相(xiang)關(guan)的(de)基(ji)因(yin)家(jia)族(zu)在(zai)深(shen)海(hai)水(shui)虱(shi)基(ji)因(yin)組(zu)上(shang)發(fa)生(sheng)了(le)顯(xian)著(zhu)擴(kuo)張(zhang),並(bing)且(qie)特(te)異(yi)性(xing)地(di)在(zai)胃(wei)和(he)腸(chang)道(dao)中(zhong)高(gao)表(biao)達(da),提(ti)示(shi)其(qi)可(ke)能(neng)與(yu)能(neng)量(liang)的(de)高(gao)效(xiao)利(li)用(yong)相(xiang)關(guan)。此(ci)外(wai),研(yan)究(jiu)人(ren)員(yuan)發(fa)現(xian)脂(zhi)質(zhi)體(ti)內(nei)脂(zhi)質(zhi)的(de)積(ji)累(lei)主(zhu)要(yao)得(de)益(yi)於(yu)其(qi)較(jiao)低(di)的(de)脂(zhi)質(zhi)代(dai)謝(xie)效(xiao)率(lv),而(er)非(fei)高(gao)效(xiao)的(de)脂(zhi)質(zhi)合(he)成(cheng)能(neng)力(li)。
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