水下考古有“章”可循 國家文物局出台首部相關行業規範
記者從西南大學資源昆蟲高效養殖與利用全國重點實驗室獲悉,實驗室代方銀教授團隊取得最新科研成果——“數字家蠶”共享分析平台,對於推動家蠶泛基因組成果在功能基因組、基因組選擇和分子設計育種等方麵的研究應用具有重要意義。相關研究成果近日在國際學術期刊《核酸研究》在線發表。
在(zai)現(xian)代(dai)蠶(can)學(xue)研(yan)究(jiu)和(he)育(yu)種(zhong)實(shi)踐(jian)中(zhong),泛(fan)基(ji)因(yin)組(zu)序(xu)列(lie)和(he)多(duo)組(zu)學(xue)數(shu)據(ju)已(yi)經(jing)成(cheng)為(wei)科(ke)學(xue)家(jia)手(shou)中(zhong)不(bu)可(ke)或(huo)缺(que)的(de)基(ji)礎(chu)資(zi)源(yuan),可(ke)以(yi)縮(suo)短(duan)研(yan)究(jiu)和(he)育(yu)種(zhong)的(de)時(shi)間(jian),顯(xian)著(zhu)提(ti)高(gao)工(gong)作(zuo)效(xiao)率(lv)。然(ran)而(er),多(duo)組(zu)學(xue)大(da)數(shu)據(ju)的(de)整(zheng)合(he)分(fen)析(xi)和(he)使(shi)用(yong)具(ju)有(you)成(cheng)本(ben)高(gao)、技術難度大的特點。
代方銀介紹,分析平台不僅涵蓋家蠶基因序列信息,還整合了家蠶基因表達、調控、功能研究等數據,提供了開展比較基因組和功能基因組等方麵研究的分析工具。
“數字家蠶”共享分析平台數據和功能示意圖。(受訪者供圖)
這是繼2022年該團隊發布家蠶超級泛基因組圖譜後,推動創建“數字家蠶”qudedeyouyizhongdajinzhan。fenxipingtaizhenghelejiacanfanjiyinzuxuliejiduozuxueshuju,jiangyigejuyoushangqiangezhongzhiziyuandexianxiashitijiyinziyuankuzhuanhuaweizuxuexulieshujukubingbanshanghulianwang,shixianzhongzhiziyuanjiyinzu、遺傳變異及表型等數據的開放共享和可視化分析。
“我們將它比喻為一部智能、高效的家蠶基因‘數字字典’或超級‘圖書館’,研究人員能在這裏快速獲取家蠶基因組相關信息。”西南大學資源昆蟲高效養殖與利用全國重點實驗室博士後陸昆鵬說。(記者周思宇)
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