新軟件精準快速識別和定位蛋白質
科技日報北京5月18日電 (記者張佳欣)冷凍電子斷層成像(Cryo-ET)是一種提供細胞環境和封閉生物分子的詳細三維(3D)圖像的強大技術。由德國馬克斯·普朗克分子生理學研究所研究團隊開發的一種軟件TomoTwin,kezaiyongjidexibaozhongtiaoxuandanbaizhi。jiyushenduduliangxuexidezhekuanxinkaiyuangongju,shikexuejianengyigaojingduhegaotongliangdingweijizhongdanbaizhi,erwuxumeicishoudongchuangjianhuozhongxinxunlianwangluo。xiangguanlunwenfabiaozaizuijinde《自然·方法》雜誌上。
TomoTwin軟件克服了許多現有工具的障礙:taxuehuizaiduancengtuxiangzhongtiaoxuanxingzhuangxiangsidefenzi,bingjiangtamenyingshedaojihekongjian。zaixuexiguochengzhong,tajiangxiangsidedanbaizhifangzhizaibicifujindexitonghuidedaojiangli,fouzehuishoudaochengfa。
該軟件為直接在細胞環境中自動識別和定位蛋白質鋪平了道路,擴大了Cryo-ET的潛力。Cryo-ET有可能破譯生物分子在細胞內的工作,並進一步揭示生命的基礎和疾病的起源。
在TomoTwin軟ruan件jian生sheng成cheng的de新xin圖tu譜pu中zhong,研yan究jiu人ren員yuan可ke分fen離li並bing準zhun確que識shi別bie不bu同tong的de蛋dan白bai質zhi,利li用yong這zhe一yi點dian來lai定ding位wei它ta們men在zai細xi胞bao內nei的de位wei置zhi。此ci外wai,該gai軟ruan件jian的de一yi個ge優you勢shi是shi,通tong過guo取qu消xiao訓xun練lian步bu驟zhou,甚shen至zhi可ke在zai本ben地di計ji算suan機ji上shang運yun行xing。
目前,該軟件可在細胞中定位大於15萬道爾頓的球狀蛋白質或蛋白質複合體。未來,研究團隊的目標是定位膜蛋白、絲狀蛋白和較小尺寸的蛋白。
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